在日本，对于12到16岁的女孩可以免费接种人乳头瘤病毒(HPV)疫苗。但由于媒体报道接种疫苗后有出现不良事件，日本政府从2013年6月起暂时不采取有力的疫苗接种方案，疫苗的接种率从70%迅速下降到1%。据统计迄今为止，由于停止HPV疫苗的接种，导致约5000例宫颈癌死亡。柳叶刀公共卫生杂志在今年2月的一篇文章指出，疫苗的高接种率可能会让未来宫颈癌死亡人数迅速减少。
HPV会导致宫颈癌、肛门癌、口咽癌以及生殖器相关癌症，截止2012年的统计就已导致63万例相关癌症。其中宫颈癌在与HPV相关的癌症中占比最大。对女孩和青少年的HPV疫苗接种可以防止定向感性和宫颈癌前病变的发展。
日本从2010年开始为12至16岁的女孩提供HPV疫苗的免费接种，最初的三剂疫苗的接种率超过了70%。但在2013年6月，日本停止了这种疫苗接种方案。尽管有很多证明表明HPV疫苗的安全性，停止接种的政策依旧持续了六年多。对于日本，该疫苗的可信度始终是不高的，也有其他的国家对该疫苗认知受到影响。
在2019年1月，世界卫生组织(WHO)将对疫苗的犹豫列为对国际健康的十大威胁之一。该团队使用经过充分验证的建模平台，将疫苗危机的影响与假设进行了比较：自2013年以来疫苗接种率约为70%。结果表明，在1994至2007年出生的人口的一生中，预计2013至2019年疫苗危机将导致24600至27300例新发病例和5000至5700例死亡病例。但是，如果接种率在2020年有所提高，则可以预防14800-16200例新发病例和3000-3400例死亡病例。如果接种率不能提高，仅在2020年年满12岁的人的一生中，就有可能再发生3400至3800例新发病例和700至800例死亡病例。
截至今日，由于日本疫苗危机(停止接种疫苗)导致宫颈癌死亡的约5,000人，而且这种危机持续下去的话，每年将增加700至800例死亡病例。
若疫苗的接种率得以迅速恢复，仍然有效可以防止许多宫颈癌和其他相关癌症的发生和死亡。不过，虽然疫苗的接种能起到一定作用，但宫颈癌的筛查依旧是优先事项，特别是对于错过疫苗接种的女性和高危风险的老年妇女。
